條碼在物流系統中的應用，主要在以下幾方面：

(1) 產線自動控制系統
現代大生產日益計算機化和信息化，自動化水平不斷提高，生產線自動控制系統要正常運轉，條碼技術的應用就成為不可或缺的了。因為現代產品性能日益先進，結構日益復雜，零部件數量和種類眾多，傳統的人工操作既不經濟也不可能。例如一輛汽車要由成千上萬個零部件裝配而成，不同型號、款式，所需要的零部件的品種和數量也不同，而且不同型號、款式的汽車往往要在同一條生產線上裝配，如果使用條碼技術對每一個零部件進行在線控制，就能避免差錯、提高效率、確保生產順利進行。使用條碼技術成本低廉，只需先對進入生產線的物品賦碼，在生產過程中通過安裝于生產線的條碼識讀設備，獲取物流信息，從而隨時跟蹤生產線上每一個物流的情況，形成自動化程度高的電子車間。
(2) 信息系統(POS系統)
目前條碼技術應用最為廣泛的領域是商業自動化管理，即建立商業POS(point of sale)系統，利用現金收款機作為終端機與主計算機相聯，借助于識讀設備為計算機錄入商品上的條碼符號，計算機從數據庫中自動查尋對應的商品信息，顯示出商品名稱、價格、數量、總金額，反饋給現金收款機開出收據，迅速準確地完成結算過程，從而節省顧客購買結算時間，更為重要的是它使商品零售方式發生了巨大的變革，由傳統的封閉柜臺式銷售變為開架自選銷售，大大便利了顧客采購商品;同時計算機還可根據購銷情況對貨架上各類商品的數量、庫存進行處理，及時提出進、銷、存、退的信息，供商家及時掌握購銷行情和市場動態，提高競爭力，增加經濟效益;對于商品制造商來說則可以及時了解產品銷售情況，及時調整生產計劃，生產適銷對路的商品。
(3) 倉儲管理系統
倉儲管理無論在工業、商業，還是物流配送業里都是重要的環節。現代倉儲管理所要面對的產品數量、種類和進出倉頻率都大為增加，繼續原有的人工管理不僅成本昂貴，而且難以為繼，尤其是對一些有保質期控制的產品的庫存管理，庫存期不能超過保質期，必須在保質期內予以銷售或進行加工生產，否則就有可能因其變質而遭受損失。人工管理往往難以真正做到按進倉批次在保質期內先進先出。利用條碼技術，這一難題就迎刃而解，只需在原材料、半成品、成品入倉前先進行賦碼，進出倉時讀取物品上的條碼信息，從而建立倉儲管理數據庫，并提供保質期預警查詢，使管理者可以隨時掌握各類產品進出倉和庫存情況，及時準確地為決策部門提供有力的參考。
(4) 自動分揀系統
現代社會物品種類繁多，物流量龐大，分揀任務繁重，例如郵電業、批發業和物流配送業，人工操作越來越不能適應分揀任務的增加，利用條碼技術實行自動化管理就成為時代的要求了。運用條碼技術對郵件、包裹、批發和配送的物品等進行編碼，通過條碼自動識別技術建立自動分揀系統，就可大大提高工作效率，降低成本。如郵政運輸局是我國最早配備自動分揀系統的單位之一，該系統的流程是:在投遞窗口將各類包裹的信息輸入計算機，條碼打印機按照計算機的指令自動打印條碼標簽，貼在包裹上，然后通過輸送線匯集到自動分揀機上，自動分揀機通過全方位的條碼掃描器，識讀、鑒別包裹，并將它們分揀到相應的出口溜槽，這樣可以大大提高工作效率，降低成本，減少差錯。在配送方式和倉庫出貨時，采用分貨、揀選方式，需要快速處理大量的貨物，利用條碼技術便可自動進行分貨揀選，并實現有關的管理。其過程如下:中心接到若干個配送訂貨要求，將若干訂貨匯總，每一品種匯總成批后，按批發出所在條碼的揀貨標簽，揀貨人員到庫中將標簽帖于每件商品上，自動分揀。分貨機始端的掃描器對處于運動狀態分貨機上貨物掃描，一方面是確認所揀出貨物是否正確，另一方面是識讀條碼上用戶標記，指令商品在確定的分支分流，到達各用戶的配送貨位，完成分貨揀選作業。
(5) 售后服務系統
大件商品或一些耐用消費品，其售后服務往往決定著其市場銷售情況和市場占有率。因此對此類商品的生產者來說，搞好客戶管理和售后服務尤顯重要。利用條碼進行客戶管理和售后服務管理不僅簡便易行，而且成本低廉，廠商只需在產品出廠前進行賦碼，各代理商、分銷商在銷售時讀取產品上的條碼，向廠商及時反饋產品流通的信息和客戶信息，建立客戶管理和售后服務管理系統，隨時掌握產品的銷售狀況和市場信息，為廠商及時進行技術革新和花色品種更新，生產適銷對路的商品提供可靠的市場依據。可見，以條碼這種標準標識“語言”為基礎的自動識別技術，大大提高了數據采集和條碼識別的準確性和速度，并可實現過程中的計算意義，實現了物流的高效率運作。